引物图怎么绘制
引物图是一种用于描述PCR反应中引物与靶标DNA结合的图示。以下是一些绘制引物图的步骤:
1. 确定引物序列:首先需要确定所使用的引物序列,包括引物的起始和终止位置。
2. 绘制靶标DNA序列:在引物序列的上下游绘制靶标DNA序列,可以使用线条或箭头表示。
3. 标注引物序列:在靶标DNA序列上标注引物序列,可以使用不同颜色或线型来区分前向引物和反向引物。
4. 标注PCR产物:在靶标DNA序列上标注PCR产物的大小,可以使用箭头或数字表示。
5. 添加其他信息:根据需要,可以添加其他信息,如引物浓度、PCR条件等。
6. 优化图像:最后,可以对图像进行优化,如调整字体大小、颜色等,以使图像更加清晰易读。
需要注意的是,引物图的绘制应该准确、清晰、简洁,以便于其他人理解和使用。
primerpremier设计引物如何保存
设计好后,点左上角的“edit”,再点“copy”,然后选择正向引物或反向引物,点击后就已经复制到剪切板里了。然后打开word、txt或者exel文件,直接ctrl+V粘贴即可。 ———————————————————————— save to database是存入了PP5自己的数据库中。就像这样: 然后你在下面选中你的引物,点export,就存进了数据库中,然后你可以编辑名字之类的。 不懂的话继续问。
如何设计引物,给出了一个基因的片段
如果是扩增已知序列目的全长基因,肯定是要在基因序列外部设计引物,当然接下来还有克隆表达等操作,最好在引物设计时考虑增加酶切位点以及添加序列标签等。
如果是扩增未知序列基因,一般要根据序列比对找到保守序列,设计兼并引物,扩增产物一般是目的基因的部分序列,还要通过3"、5‘race以及染色体步移等操作得到全长序列。
怎样根据mRNA设计引物
先找到基因的mRNAX序列。
引物设计参数:
a
引物长度一般在20bp左右,上下游引物碱基长度不要相差超过4个碱基。
引物退火温度一般在58度,不同软件TM使用不同的算法,primer3,primer
5,primer
6,primer
express等一般可以设置在55-58度,beacon
design可以设置在65左右。
c
GC含量一般没什么特殊要求,40-60最好,如果不好设计,30-80也是可以的。
d
产物长度在100-150,80-200也可以,不要在50bp左右,那样和引物二聚体不好区分,超过200bp可能会影响PCR扩增。
e
软件给出的引物不能有发卡结构和超过3-4个碱基的匹配,特别是3`端不能有碱基匹配,那样更容易形成二聚体。
f
引物设计好以后,在NCBI上做一个primer-blast,检测一下是否有非特异性扩增。
诺唯赞上如何设计引物
引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与目的基因一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与目的基因另一端的另一条DNA模板链互补。在PCR(聚合酶链式反应)技术中,已知一段目的基因的核苷酸序列,根据这一序列合成引物,利用PCR扩增技术,目的基因DNA受热变性后解链为单链,引物与单链相应互补序列结合,然后在耐高温DNA聚合酶作用下进行延伸,如此重复循环,延伸后得到的产物同样可以和引物结合。
还没有评论,来说两句吧...